结石对机体产生损害的基础是尿路梗阻。肾盏结石如静止不动，不一定引起明显梗阻，可不出现症状；若结石嵌顿在肾盏颈部，则引起肾盏扩张积水。最容易引起梗阻的是输尿管结石，如结石嵌顿在肾盂输尿管交界部，可引起肾积水。结石在输尿管中、下段梗阻，可导致结石以上的输尿管扩张及积水。肾盂积水程度不同。肾盂内压力也不同。轻度肾积水时，肾盂内压力增大，肾髓质小管扩张，。肾小球和皮质基本正常，肾脏泌尿功能尚好；中度肾积水时则病变累及部分肾小球，大部分肾小球玻璃样变，少部分代偿性肥大，肾脏泌尿功能严重受损，导致肾盂内压力减小；重度肾积水时，肾实质高度萎缩，皮质和髓质界限消失，成囊袋状，肾实质薄如纸，肾脏泌尿功能基本丧失，肾盂内压力最低到零（图4-6）

  尿路梗阻引起肾积水是尿液的分泌、排泄及重吸收3者之间失平衡的结果。正常肾盂内压为O．1～O．98kpa(1～10cmH2o)，尿路梗阻导致肾积水时，肾盂内压可高达2．45～5.88kPa(25～60cmH2o)，从而引起肾脏一系列生理与病理改变。改变的速度和程度除与肾盂内压的高低、尿路梗阻的时间和程度有关外，还取决于肾盂解剖形态的变异和肾脏血液供应情况，以及有无并发尿路感染等因素。
  肾盂内压力增高首先引起肾盂扩张，而后引起肾盏扩张。肾盂、肾盏扩张的程度与肾盂的解剖类型有一定关系。肾外型肾盂积水，肾盂向外扩张，对肾实质的损害较轻或较慢；肾内型肾盂积水，因肾盂无扩张余地，而在肾内扩张，可较早地引起肾盏扩张，故对肾实质的损害较早，而且较重。严重的肾积水导致皮质部的肾小管、肾小球系统相继退化，并被纤维组织所取代，肾皮质严重萎缩、变薄、肾功能可完全丧失。急性完全性梗阻比慢性部分梗阻进程快，且严重；单侧梗阻进程比双侧快,但远期结果好。梗阻后易出现感染，感染又加速疾病的发展，较早出现合并症，肾功能破坏加速。
  输尿管结石的病理变化均与梗阻有关。其变化过程为：输尿管结石梗阻-输尿管迂曲扩张-输尿管壁肌肉增厚-输尿管炎和输尿管周围炎-输尿管纤维化-输尿管狭窄。多次结石通过可引起输尿管狭窄，无感染者狭窄上方输尿管扩张、结石滞留，有感染者即出现肾盂肾炎和脓肾。
  膀胱结石间歇性或持续性地阻塞尿道内口，可引起膀胱壁增厚及尿潴留。如果长时间持续性尿潴留，则可引起尿毒症。